FASTA

定义 Definition

n. 生物信息学中的一种文本序列格式，也指早期的序列相似性搜索工具家族。作为文件格式，它用于存储 DNA、RNA 或蛋白质序列；每条记录通常由以 > 开头的描述行和后续序列字母行组成。FASTA 文件常用于基因组数据库、序列提交、序列比对和 BLAST 等分析流程的输入或输出。

发音 Pronunciation

/ˈfæstə/

例句 Examples

The lab saved the DNA sequence in FASTA format.
实验室把这段 DNA 序列保存为 FASTA 格式。

Before running the alignment, the researcher checked whether each FASTA record had a clear identifier and a valid sequence.
在运行比对之前，研究人员检查了每条 FASTA 记录是否有清楚的标识符和有效的序列。

词源 Etymology

FASTA 这个名称源于早期序列搜索程序的命名传统，与 fast “快速的” 有关，用来强调序列相似性搜索的速度。后来，这个名称也广泛用于指代该类工具所使用和推广的简洁序列文本格式。

科学文献用例 Scientific Usage

生物信息学教材中常用 FASTA 格式示例说明如何表示核酸或蛋白质序列。
基因组数据库和序列提交指南通常要求或支持 FASTA 文件作为标准输入格式之一。
序列比对、注释和数据库搜索的实验报告中常写到将样本序列保存为 FASTA 文件后再进行分析。